Introduction à la biochimie<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

Biochimie = étude des substances et des procédés chimiques produit dans l’organisme vivant (espace vivant) qui en continuel renouvellement<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

L’étude des substances se fait par :<o:p></o:p>

- Identification<o:p></o:p>

- Localisation<o:p></o:p>

- Structure<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

Tout ça se fait par des mécanismes réactionnels (réactions chimiques) qui sont nécessaires à la survie de la cellule.<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

La survie de la cellule se fait sur un tryptique :<o:p></o:p>

- Molécules de base<o:p></o:p>

- Energie<o:p></o:p>

- Mécanismes réactionneles<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

/ !\ il n’y a pas de réaction indépendantes<o:p></o:p>

<o:p></o:p> 

<o:p></o:p>

L’énergie et la matière sont à générer en même temps

 

L'énergie vient des nutriments (GPL ayant un haut poids moléculaire / macromolécules riche en énergie) qui vont se dégrader.<o:p></o:p>

<o:p></o:p> 

<o:p></o:p>

/ !\ La cellule ne gaspille rien (énergie / molécules)<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

Homéostasie è constance d’un concentration <o:p></o:p>

Si altération de l’homéostasie, il y a pathologie<o:p></o:p>

Bioénergétique<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

Énergie utile / libre : énergie pour réaliser un travail, c’est un échange il n’y a pas de perte.<o:p></o:p>

Énergie cellulaire : perte sus forme de chaleur.<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

L’énergie est apportée par l’alimentation.<o:p></o:p>

La cellule est un système ouvert, c’est à dire qu’il y a un échange avec le milieu extérieur à pression et température constante.<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

I)            Couplage énergétique <o:p></o:p>

Il n’y a pas de réaction indépendante et aléatoire, il existe une voie métabolique.<o:p></o:p>

La réaction a toujours la même finalité<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

La réaction a des contraintes énergétiques suivant les lois de la thermodynamique.<o:p></o:p>

Elles sont alors réparties lors du bilan final de la voie métabolique.<o:p></o:p>

Pour effectuer une réaction on doit atteindre un niveau d’énergie qui respecte les lois de la thermodynamique. <o:p></o:p>

Quand la variation d’énergie ou le niveau d’activation est trop important cela est incompatible avec la cellule è on utilise donc un catalyseur qui est une enzyme spécifique à la réaction è elle facilite la réaction en puisant un minimum d’énergie.<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

On peut utiliser aussi le découplage réactionnel qui diminue les barrières énergétiques et empêche la dispersion d’énergie sous forme de chaleur.<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

Lors du catabolisme l’énergie libérée est capté et est transporté par l’ATP.<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

Il existe deux variations d’énergie quand on a une réaction :             - cinétique : réalise un travail<o:p></o:p>

                                                                                                         - potentielle : contenue dans une macromolécule<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

·      Les lois de la thermodynamique<o:p></o:p>

L’énergie totale doit être constante<o:p></o:p>

L’entropie augmente, elle tend vers le désordre<o:p></o:p>

L’équation de Gibbs est alors modifié :<o:p></o:p>

<o:p></o:p>

Si ΔG = 0 la réaction est fini<o:p></o:p>

Si ΔG ≠ 0 la réaction est en cours<o:p></o:p>

ΔG permet de dire le sens de la réaction :           ΔG > 0  la réaction est endergonique / instable<o:p></o:p>

                                                                      ΔG < 0  la réaction est exergonique / apport d’énergie<o:p></o:p>

La voie métabolique doit être exergonique.<o:p></o:p>

On calcule donc ΔG = ΔG₀ + RT ln[B]/[A]<o:p></o:p>

Avec ΔG₀ l’état standard pH = 0, T = 25°C, P = 1 atm et à 1 mol.L^-1  è ce n’est pas possible dans la cellule sauf en cas d’oxydo-réduction)<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

II)         Type de réaction <o:p></o:p>

1)  Réversible <o:p></o:p>

|ΔG| faible <o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

2)  Irréversible<o:p></o:p>

|ΔG| important avec une quantité d’énergie quand A à B<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

Les réactions du type A à B à C à D à E sont réversibles et irréversibles (en amont).<o:p></o:p>

Cela permet de répondre aux contraintes énergétiques, de rendre A irréversible et de permettre à l’enzyme qui catalyse d’exercer sa fonction de régulation<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

Ainsi on a une barrière qui empêche la réaction de se faire spontanément  è l’énergie d’activation.<o:p></o:p>

Exemple : Chauffage  è      Éther (Énergie d’activation faible) s’enflamme<o:p></o:p>

                                               Sucre (Énergie d’activation important) a besoin de beaucoup de chaleur pour se dégrader<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

                   Phosphorylation è      Glucose ne peut pas sortir de la cellule et a un niveau énergétique élevé.<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

On effectue alors un couplage réactionnel à l’hydrolyse : ATP à ADP + Pi<o:p></o:p>

L’ATP est une molécule à fort potentiel énergétique (ΔG = -31 kJ.mol^-1). <o:p></o:p>

On apporte autant d’ATP que nécessaire pour une réaction<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

III)      Étude d’une molécule à haut potentiel d’énergie (HPE)<o:p></o:p>

Dans chaque réaction il y a dispersion d’énergie (chaleur)<o:p></o:p>

La cellule est un espace ouvert qui travaille à état stationnaire pour survivre<o:p></o:p>

- Etat stationnaire : lutte contre l’entropie, la grandeur reste constante<o:p></o:p>

- Etat d’équilibre : mort cellulaire<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

Loi de Lechatelier = loi d’action de masse è quand il y a augmentation de A il y a augmentation de E<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

Il n’y a pas de dégradation, pas de création mais il y a transformation.<o:p></o:p>

Une voie métabolique peut être inversée<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

1)  Liaison HPE<o:p></o:p>

Liaison phosphoanhydre<o:p></o:p>	Quand est hydrolysé : libère beaucoup d’énergie<o:p></o:p> ATP en possède 2<o:p></o:p>
Liaison thioester<o:p></o:p>	Fixation d’un COOH sur un SH du CoA<o:p></o:p> Hydrolyse les AG<o:p></o:p>
Liaison amidine phosphate<o:p></o:p>	Créatine sous forme phosphorylé<o:p></o:p>
Liaison enol-phosphate<o:p></o:p>	-60 kJ è c’est la molécule la plus énergétique<o:p></o:p> elle est présente dans la dernière étape de la glycolyse<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

2)  L’ATP<o:p></o:p>

C’est un transporteur universel d’énergie<o:p></o:p>

Il est présent dans toutes les cellules (75g/jour pour 45kg)<o:p></o:p>

3 liaisons : 2 phosphoanhydre (β et γ) et 1 phosphoester (α)<o:p></o:p>

Il y a un turn over è création de 10 ATP pour 1 ADP<o:p></o:p>

C’est une moléucle instable qui a 4 charges - è tend vers vers la stabilité par hydrolyse<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

/ !\ l’ADP ne donne jamais d’énergie par hydrolyse<o:p></o:p>

L’AMP relié à un sucre par une liaison thioester est une molécule HPE<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

·      La synthèse d’ATP<o:p></o:p>

Rephosphorylation de l’AMP et de l’ADP<o:p></o:p>	Transfert du phosphate de la GTP sur ADP <o:p></o:p>
Oxydation phosphorylante<o:p></o:p>	<o:p> </o:p>
Phosphorylation liée au substrat<o:p></o:p>	Dans les cellules exprimant la créatine phosphokinase<o:p></o:p>
Adénylate kinase<o:p></o:p>	Dans le muscle strié<o:p></o:p>
Turn over<o:p></o:p>	Molécule considérée comme HPE quand E > 31kJè transfert vers ATP<o:p></o:p> à Transfert phosphate sur substrat<o:p></o:p> à Hydrolyse phosphate : non nécessaire à la réaction<o:p></o:p> SCHEMA<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

<o:p> </o:p>

IV)      Voie anaérobie alactique (molécules impliqués)<o:p></o:p>

1)  Créatine phosphate<o:p></o:p>

- Réserve la plus mobilisable des muscles (provient de l’ATP mitochondrial qui régénère l’énergie de l’ATP cytoplasmique)<o:p></o:p>

- Structure è synthétisé à partir des AA puis transféré à l’ATP<o:p></o:p>

- État basal è la cellule a teminé son travail et reconstitué ses réserves (niveau énergétique créatine > créatine P)<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

CPK créatine phosphokinase (catalyse les réactions irréversibles)<o:p></o:p>

·      CPK-2 (dimère)<o:p></o:p>

- soluble dans le cytosol et dans l’espace inter-membranaire<o:p></o:p>

- présente lors de l’effort (déphosphorylation)<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

·      CPK-8 (octamère)<o:p></o:p>

- phosphorylation lors du repos è reconstitue réserve énergétique<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

* durant le travail <o:p></o:p>

consomme ATP è CPK-2 dans cytosol<o:p></o:p>

SCHEMA<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

* quand travail terminé<o:p></o:p>

pas de consomation d’ATP è CPK-8 dans membrane inter-mitochondriale<o:p></o:p>

SCHEMA<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

2)  Adénylate kinase / Myokinase<o:p></o:p>

*Dans cytosol<o:p></o:p>

SCHEMA<o:p></o:p>

MK et CPK sont utilisé dans des voies métaboliques courtes en anaérobie<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>	Début effort<o:p></o:p>	Récupération<o:p></o:p>
Substrat<o:p></o:p>	ADP – Créatine P<o:p></o:p>	ATP – AMP – Créatine<o:p></o:p>
Produit<o:p></o:p>	ATP – AMP - Créatine<o:p></o:p>	ADP – Créatine P<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

*Détails<o:p></o:p>

L’ATP atteint 0% en 1 minute<o:p></o:p>

La voie anaérobie alactique est rapide pour crée de l’ATP à partir de créatine P<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

Créatine P + 3 ADP + H⁺ ó Créatine + 2 ATP +  AMP<o:p></o:p>

/ !\ AMP et Ca²⁺ sont des médiateurs<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

V)         Potentiel redox<o:p></o:p>

L’oxydation est la perte d’un électron ou d’un H⁺ è l’élément est réducteur è il s’oxyde<o:p></o:p>

La réduction est le gain d’un électron ou d’un H⁺ è l’élément est oxydant è il se réduit<o:p></o:p>

AH₂ è A + 2H⁺ + 2e<o:p></o:p>

B + 2H⁺ + 2e  è BH₂<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

 

 

 

 

<o:p> </o:p>

Au niveau de la CRM et PO (phosphorylation oxydative) il y a transfert d’électron<o:p></o:p>

FADH₂ è 2 ATP<o:p></o:p>

NADH è 3 ATP<o:p></o:p>

 

 

 

 

 

 

 

 

 

<o:p> </o:p>

Carbone asymétrique suivant la position de son OH peut-être α (au dessous du plan) ou β (au dessus du plan)<o:p></o:p>

Les deux anomères n’ont pas les mêmes propriétés<o:p></o:p>

Pour passer d’un anomère à l’autre on fait une maturotation en passant par la forme linéaire<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

1)  Pyrane (5C)<o:p></o:p>

Carbone anomérique en position 1 <o:p></o:p>

Fonction OH du C5 forme un pont<o:p></o:p>

En structure chaise : si le OH du C1 est en bas è α (HPE, pas stable, configuration trans)<o:p></o:p>

                                   Si le OH du C1 est en haut è β (FPE, plus stable, configuration cis)<o:p></o:p>

On a plus de β qua de α dans l’organisme<o:p></o:p>

Il existe 3 formes en même temps (2 cyclique et une linéaire), seule la linéaire est active <o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

2)  Furane (4C)<o:p></o:p>

2 anomères α et β en C2<o:p></o:p>

C’est une forme moins stable que le pyruvate<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

3)  Propriétés du carbone anomérique<o:p></o:p>

Type de réactions<o:p></o:p>	Amination<o:p></o:p>	Liaison N-glycosidique<o:p></o:p>
	Vis à vis d’un groupement hydroxyle<o:p></o:p>	Liaison O-glycosidique (création d’un polymères de monosaccharides)<o:p></o:p>
	Vis à vis de l’acide phosphorique<o:p></o:p>	Élève le niveau énergétique / active le sucre<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>	Isomérisation<o:p></o:p>	Isomère de fonction<o:p></o:p>
	Épimérisation<o:p></o:p>	Même formule développé mais OH diffère<o:p></o:p>
	Estérification<o:p></o:p>	Fixation d’un groupement phosphate<o:p></o:p>
	Acidification des sucres par oxydation<o:p></o:p>	OH en C6<o:p></o:p>
	Formation d’une pseudo cétone<o:p></o:p>	<o:p> </o:p>
	Rupture du cycle pyrane<o:p></o:p>	Réduction fonction aldéhyde<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

<o:p> </o:p>

V)         Liaisons osidiques<o:p></o:p>

C’est le ciment de la polymérisation des mono et polysaccharides<o:p></o:p>

Ces liaisons impliquent toujours un carbone anomérique et une des fonctions hydroxyles de l’autre sucre (sauf celui qui est impliqué dans la cyclisation)<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

Liaison glycosidique è diholoside + H20<o:p></o:p>

Les aldoses ont un pouvoir oxydant quand ils sont linéaire (la liqueur de Fehling linéarise les aldoses)<o:p></o:p>

Certains cétoses après énolisation deviennent oxydants<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

Pour qu’un polysaccharide soit dit réducteur il faut qu’un de ces carbones anomériques soit libre<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

VI)      Les disaccharides<o:p></o:p>

1)  Diholosides non réducteurs<o:p></o:p>

- Implique les carbones anomériques de chaque ose è pas de pouvoir réducteur<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

2)  Diholosides réducteurs<o:p></o:p>

- Engage un seul carbone anomérique è garde les capacités réductrices<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

3)  Les différents disaccharides<o:p></o:p>

Maltose<o:p></o:p>	2 glucose<o:p></o:p>	Liaison α(1à4)<o:p></o:p>	Peut être hydrolysé<o:p></o:p>
Isomaltose<o:p></o:p>	2 glucose<o:p></o:p>	Liaison α(1à6)<o:p></o:p>	<o:p> </o:p>
Cellobiose<o:p></o:p>	2 glucose<o:p></o:p>	Liaison β(1à4)<o:p></o:p>	Rejeté<o:p></o:p>
Lactose<o:p></o:p>	Galactose-Glucose<o:p></o:p>	Liaison β(1à4)<o:p></o:p>	Intolérance (cause : déficit enzyme lactase)<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

/ !\ deux anomères (1 métabolisé / 1 rejeté) è oblige à avoir le conformation optimale <o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

VII)   Les polysaccharides<o:p></o:p>

- Ils peuvent être linéaires (toujours le même type de liaison) ou branchés/ramifiés (permet de condenser).<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

1)  Les homopolysaccharides<o:p></o:p>

            → Amidon (forme de stockage du glucose chez les végétaux)<o:p></o:p>

- L’amidon peut être ramifié par le biais de liaisons α(1→6) ou non avec uniquement des liaisons α(1→4).<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

            → Glycogène (forme de stockage du glucose dans les cellules hépatiques et musculaires)<o:p></o:p>

- Présence de liaisons α(1→4) et α(1→6), support de la ramification.<o:p></o:p>

- Organisé de façon à ne laisser qu’une seule extrémité réductrice, située au niveau du C initial.<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

2)  Les hétéropolysaccharides<o:p></o:p>

- Polymérisation de monosaccharides et d’entités non glucidiques<o:p></o:p>

- Possède plusieurs fonctions : Mise en place des structures tridimensionnels protéique<o:p></o:p>

                                                     Protection des protéines<o:p></o:p>

                                                     Interaction cellule-cellule quand partie protéique<o:p></o:p>

                                                     Spécificité expérience cible antigénique<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

3)  Glycoprotéines (Gp)<o:p></o:p>

- Fixation de résidus glucosidiques sur les protéines post-traductionnelles participant à la fonction finale.<o:p></o:p>

- Structure : glucosamine et galactosamine + acide N-acétylneuraminique conférant son acidité à la Gp.<o:p></o:p>

- Les cupules glucidiques sont importantes et leurs fonctions biologiques sont variées (ex : protection des cellules lorsque les protéases sont déversées sur le bol alimentaire).<o:p></o:p>

- Deux types d’association des cupules glucidiques sur les protéines :<o:p></o:p>

            → Gp de type N-glycosylée si la cupule glucidique est fixée via une asparagine sur la fonction amine de la protéine avec un carbone anomérique.<o:p></o:p>

            → Gp de type O-glycosylée si la cupule glucidique est fixée sur des sérines ou thréonines par le biais des OH avec un carbone anomérique.<o:p></o:p>

è La glycolisation et la cupule glucidique se font en dehors du cytosol<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

4)  Glycolipides<o:p></o:p>

- Hétéropolysaccharides dont la cupule glucidique qui se fixe au lipide peut être un monosaccharide ou une structure plus complexe.<o:p></o:p>

è Localisation sur la membrane externe plasmique (beaucoup de tissu nerveux)<o:p></o:p>

Si sucre simple<o:p></o:p>	Cérébrosides<o:p></o:p>	Glucocérébrosides<o:p></o:p>
		Galactocérébrosides<o:p></o:p>
Si sucre complexe<o:p></o:p>	Gangliosides<o:p></o:p>	Glucose<o:p></o:p>
		Galactose<o:p></o:p>
		Sucre avec N-acétyl<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

<o:p> </o:p>

5)  Protéoglycanes<o:p></o:p>

- Résultat d’une hétéropolymérisation (glucose oxydé + N-acétyl glucosamine)<o:p></o:p>

è Membrane basale permet communication dan la cellule<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

Les lipides<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

- 15% dans l’organisme

- Essentiellement hydrophobes è totalement ou avec tête hydrophile

- Répond aux contraintes du milieu biologique è mise en place d’un bicouche lipidique (partie hydrophobe au cœur de la bicouche)

Cette bicouche lipidique peut être sous deux formes : è Micelles (fonction détergente)

                                                                                            è Liposomes (membrane plasmique)

<o:p> </o:p>

<o:p> </o:p>

I)            Propriétés des lipides<o:p></o:p>

- Structure apolaire (TG) / bipolaire (AG)

- Fonction :    - source d’énergie

                       - structure des membranes

                       - rôles biologiques

<o:p> </o:p>

<o:p> </o:p>

II)         Classification<o:p></o:p>

1)  Les lipides simples<o:p></o:p>

- AG : molécules bipolaires, chaine aliphatique saturé ou non terminé par un COOH

- Glycérides : alcool + AG par liaison ester

- Cérides : /

- Stéroïdes : base des hormones / non glycéride polycyclique

<o:p> </o:p>

2)  Les lipides complexes<o:p></o:p>

- Glycérophospholipide : atome de phosphate + glycérol + AG

- Sphingolipide phosphaté : sphongosine + phosphate + AG

- Sphingolipide non phosphaté : sphingosine + ose + AG

<o:p> </o:p>

<o:p> </o:p>

III)      Les lipides simples<o:p></o:p>

1)  Les acides gras (AG)<o:p></o:p>

·      Structure

Acide carboxylique en fin de chaine aliphatique (22C maximum)

Chaine aliphatique saturé (liaison simple) ou insaturés (double liaisons 6 maximum en configuration cis)

<o:p> </o:p>

·      Nomenclature

- Nombre de C

- Suffixe -oïque

- Entre les deux :      Si saturé : an

                                   Si insaturé : en

<o:p> </o:p>

a)  AG mono-insaturés<o:p></o:p>

- Spécifie le nombre de C                                       C ..

- 1 pour le nombre de double liaison                   1

- Le numéro du C de la double liaison                 (..C) à compter à partir de l’acide carboxylique<o:p></o:p>

            Exemple : C18 :1(9C)<o:p></o:p>

 

b)  AG polyinsaturés<o:p></o:p>

Structure malonique : 3 carbones entre chaque doubles liaisons (en configuration cis)

 - Spécifie le nombre de C                                     

- Le nombre de double liaison                  

- Δ+n° des doubles liaisons ou (n° des carbones)

            Exemple : C18 :3(Δ^9,12,15)    ou   C18 :3(9C,12C,15C)<o:p></o:p>

<o:p> </o:p>

·      Biosynthèse

AG saturés è Désaturase (enzyme) è AG insaturés

Les désaturases sont des enzymes de désaturation des AG

Il en existe une pour chaque insaturation è dans le monde animal n’existe que celles désaturant Δ9 et les précédentes.

Elles ne peuvent agir q’une seule fois par AG et dans l’ordre d’apparition en partant du COOH

<o:p> </o:p>

·      Les indispensables (proviennent de l’alimentation)

Structure oméga : compte le nombre de double liaison en partant de N-terminal

<o:p> </o:p>

o   Oméga 6 (AG de base indispensable)

2 doubles liaisons (C6 à partir de l’extrémité)

<o:p> </o:p>

o   Oméga 3 (AG de base indispensable)

3 doubles liaisons (C3 à partir de l’extrémité)

<o:p> </o:p>

2)  Les non glycérides<o:p></o:p>

a)  Les cérides<o:p></o:p>

On n’en parle pas dans ce cours

<o:p> </o:p>

b)  Les stérides<o:p></o:p>

Noyau stérane : alcool + noyau polycyclique de 17C (en structure plane et rigide)

Noyau polycyclique = 3 cycles à 6C (ABC) et 1 cycle à 5C (D)

<o:p> </o:p>

Stéride : estérification AG sur alcool du stérol

è Ramification aliphatique sur C17 :      - Stérols

                                                                      - Acide et sels biliaires

                                                                      - Stéroïdes hormonaux

<o:p> </o:p>

·      Type de modification :        - un ou plusieurs groupements hydroxyles

- une ou plusieurs doubles liaisons sur A et B

- ramification sur C17

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Dérivés des stérols<o:p></o:p>

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a.    Cholestérol<o:p></o:p>

- Stérol animal présent dans structure membranaire

- Précurseur : hormone, vitamine D

- OH en C3

- Double liaison en C5-C6

- Ramification importante

- Conserve fluidité de la memebrane biologique (déplacement protéine et molécules hydrophobe dans la bicouche lipidique)

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b.    Acides biliaires<o:p></o:p>

- 3 groupements OH + COOH à la fin de la ramification en C17 (Amphiphile)

- Synthétisé par le foie, concentré dans la bille è digestion enzymatique (lipase) / élimination

- Formation en micelle è solubilisation des lipides

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c.     Hormones stéroïdiennes<o:p></o:p>

- dérivé du cholestérol

- Ramification en C3 et C17

- Double liaison soit sur A ou sur B

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3)  Les glycérides<o:p></o:p>

Triglycéride è stockage des AG è totalement hydrophobes è permet estérification d’un glycérol par 3AG (trialcool)

Il encapsule les lipoprotéines pour se déplacer

Il existe deux type de TG :  - Simple è 3 AG identique (rare)

                                               - Mixte è AG différent

Insaturation en G2 du glycérol

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IV)      Les lipides complexes<o:p></o:p>

- Mise en place de la membrane biologique

- Hétérolipides

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1)  Les phospholipides (groupement phosphate)<o:p></o:p>

a)  Glycérophospholipide<o:p></o:p>

·      Structure : glycérol + 2 AG + acide phosphorique è acide phosphatique

à donne les précursuers des glycérophospholipide

Glycérophospholipide = acide phosphatique + alcool

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Il existe 5 type de glycérophospholipide :

Feuillet interne è fonction de structure / biologique	Sérine	Phosphatidylsérine
<o:p> </o:p>	Éthanolamine	Phosphatidyléthanolamine
Feuillet externe	Choline	Phosphatidylcholine
<o:p> </o:p>	Glycérol	Phosphatidylglycérol
Feuillet interne	Myo-inositiol	Phosphatidylinositol

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·      Bicouche lipidique

2 couches amphiphiles ==W chaine aliphatique hydrophobes au centre

Les têtes glycérophospholipides sont hydrophiles dans le milieu biologique

Les résultats des contraintes hydrophiles-hydrophobes donnent une stabilité

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Si par réaction enzymatique on enlève la chaine aliphatique 1 ou 2, on obtient une structure lyso-phospholipide (détergent en micelle) è perte de la sélectivité de la perméabilité membranaire.

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·      Phospholipases

Ce sont des enzymes de dégradation des phospholipides et donne des lyso-phospholipides

PLA1 (AG saturé) / PLA2 (AG insaturé)	Dégradation des AG
PLC	Libère diacylglycérol + dérivé phosphorylé
PLD	Libère acide phosphatique + un alcool

L’hydrolyse permet la synthèse de médiateur lipidique

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b)  Sphingophospholipide<o:p></o:p>

- Composant essentiel des membranes biologique

- Structure : Sphingosine + AG è céramide

La céramide est un précurseur des sphingophospholipides

La sphingosine est une chaine aliphatique insaturé en C1 (hydroxyle è porte soit un glucide, alcool phosphorylé), C2 (amine), C3 (hydroxyle)

On obtient donc 4 classes de sphingophospholipides

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2)  Les glycolipides (sphingosine non phosphaté)<o:p></o:p>

- Se trouve dans le tissu nerveux

- La tête est fortement hydophile avec des liaisons glucosidiques avec CH du C1

- La structure est une céramide mais absence de groupement phosphate

- Présent à l’extérieur de la membrane plasmique è cupule glucidique n’a pas de contact avec le cytosol

- 2 classes :    - Glucose : membrane plasmique

                       - Galactose : tissu nerveux

- Fonction : interaction cellulaire / croissance + développement + expansion site antigénique

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Les méthodes de séparation d’une protéine<o:p></o:p>

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I)            Électrophorèse<o:p></o:p>

- Séparation selon la masse moléculaire avec un gel de polyacrylamide caractérisé par la réticulation (maillage)<o:p></o:p>

- Protéines migrent du haut vers le bas (plus une molécule est grosse moins elle migre)<o:p></o:p>

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1)  Neutralisation des charges è pré-électrophorèse<o:p></o:p>

Casse toutes les liaisons (seule structure primaire reste)<o:p></o:p>

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2)  Dénaturation protéique<o:p></o:p>

Rend toutes les protéines négatives grâce à :<o:p></o:p>

- un mélange de β-mercaptoethanol avec une protéine pour casser le pont disulfure<o:p></o:p>

- chauffage<o:p></o:p>

- ajout de SDS (détergent amphiphiles) rend toutes les protéines négatives<o:p></o:p>

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3)  Identification des protéines<o:p></o:p>

On utilise des marqueurs dont on connaît le poids moléculaire<o:p></o:p>

On les colore avec du bleu de coomassie qui se fixe sur les résidus aromatiques<o:p></o:p>

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            Immunogéinité (création d’anticorps contre la protéine) è Western blot<o:p></o:p>

- Sors protéine du gel grâce à un champ électrique sur membrane hydrophobe <o:p></o:p>

- Fixe protéine sur la partie basse de l’anticorps (sans modifier le rôle de l’anticorps) <o:p></o:p>

- Fixation de l’anticorps coloré dirigé contre l’anticorps fixant la protéine<o:p></o:p>

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4)  Électrophorèse bidimensionnelle<o:p></o:p>

Utilise la charge et la masse moléculaire<o:p></o:p>

- Focalisation isoélectrique : sépare les molécules selon le pH de la forme zwitterrionique <o:p></o:p>

Quand charge nette = 0 il n’y a plus de migration<o:p></o:p>

Si pH alcalin (négative) / pH acide (positive)<o:p></o:p>

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II)         Chromatographie<o:p></o:p>

1)  Exclusion d’un gel<o:p></o:p>

Séparation par la taille è bille poreuse capture petit poids moléculaire<o:p></o:p>

Plus la molécule est grosse plus elle descend<o:p></o:p>

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2)  Échangeurs d’ion<o:p></o:p>

Séparateur par charge nette (utilisation de NaCl)<o:p></o:p>

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III)      Spectrométrie de masse<o:p></o:p>

Protéine ionisée par laser provoque un déplacement ± rapide dans un canon<o:p></o:p>

Les plus légers arrivent en premier sur la cellule de détection<o:p></o:p>

C’est une technique complémentaire à l’électrophorèse bidimensionnelle<o:p></o:p>

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