• Indicateur en épidémiologie

    Par lafandemusic1994 le 13 Août 2014 à 19:50

    Indicateur en épidémiologie<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    I)            Rappel<o:p></o:p>

    Il y a deux types de statistiques : les diagnostiques et les thérapeutiques.<o:p></o:p>

    Les données sont les résultats de l’observation.<o:p></o:p>

    Si on peut la mesurer, la variable peut être :<o:p></o:p>

    - qualitative : 1 modalité (binaire ou nominale) ou 2 modalités (en tableau)<o:p></o:p>

    - quantitative : associée à un nombre<o:p></o:p>

    - ordinale : peuvent être ordonnées<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    Les données qualitatives peuvent être sous forme de tableau, camembert, diagramme en bâtons. Quand il y a beaucoup de réponses qualitatives, on calcule la fréquence à une réponse.<o:p></o:p>

    Les données quantitatives sont calculés sous forme d’effectifs cumulés croissants 

    Capture d’écran 2014-08-13 à 19.47.25

    On peut aussi avoir un histogramme par intervalle [a ; b], p = h(b – a)<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    II)         Paramètres statistiques<o:p></o:p>

    Capture d’écran 2014-08-13 à 19.47.08

     

    III)      Applications <o:p></o:p>

    Épidémiologie descriptive : fréquence et répartition des problèmes de santé<o:p></o:p>

    Épidémiologie analytique (hypothèse) : cause<o:p></o:p>

    Épidémiologie évaluative (validation hypothèse) : apprécie les résultats/actions<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    ·      Indicateur en épidémiologie<o:p></o:p>

    Permet de mesurer l’état de santé :<o:p></o:p>

    - sociodémographique<o:p></o:p>

    - sanitaire<o:p></o:p>

    - utilisation des services de santé<o:p></o:p>

    - mesure activité et évalue<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    ·      Mesure épidémiologique<o:p></o:p>

    - proportion : en pourcentage<o:p></o:p>

    - ratio : rapport entre deux classes<o:p></o:p>

    - cote : rapport de probabilité survenue et non survenue<o:p></o:p>

    - indice : rapport de deux effectifs de nature différentes<o:p></o:p>

    - taux : rapport prenant en compte la notion de temps<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    Capture d’écran 2014-08-13 à 19.47.33


    votre commentaire

  • Statistiques interférentielles en épidémiologie

    Par lafandemusic1994 le 13 Août 2014 à 19:46

    Statistiques interférentielles en épidémiologie<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    <o:p> </o:p>

    Capture d’écran 2014-08-13 à 19.43.14


    <o:p></o:p>

    Une hypothèse est une relation entre deux variables, une problématique de recherche.<o:p></o:p>

    Une inférence permet une généralisation à partir d’un échantillon, d’une population source jusqu’à une population cible.<o:p></o:p>

    Le risque est une probabilité d’être atteint d’une maladie.<o:p></o:p>

    Le risque relatif est le risque d’être exposé sur le risque d’être non exposé.<o:p></o:p>

    Le facteur de risque est un facteur influençant la survenue d’un problème de santé.<o:p></o:p>

    L’intervalle de confiance du risque relatif = 95%<o:p></o:p>

    Si l’intervalle contient 1 alors l’association est dite non significative et p ≥ 5%<o:p></o:p>

    Si l’intervalle ne contient pas 1 alors l’association est dite significative et p < 0,05<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    I)            Problème des enquêtes d’observation<o:p></o:p>

    Biais de sélection<o:p></o:p>

    Constitution des groupes, non représentatif<o:p></o:p>

    Réglé par un TAS<o:p></o:p>

    Biais de mesure<o:p></o:p>

    Mesure de l’exposition à la maladie en sous/surestimation<o:p></o:p>

    On doit bien faire la distinction entre malades et non malades<o:p></o:p>

    Problème de comparabilité des groupes<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    <o:p> </o:p>

    Biais de confusion<o:p></o:p>

    Concerne la non comparabilité des groupes pour différents facteurs autre que la facteur étudié<o:p></o:p>

    Il faut bien appareiller et ajuster les groupes<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    II)         Enquête de cohorte<o:p></o:p>

    C’est une enquête prospective sur l’exposition au facteur de risque chez un individu sain<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    Malade<o:p></o:p>

    Non malade<o:p></o:p>

    Total <o:p></o:p>

    Exposition<o:p></o:p>

    a<o:p></o:p>

    b<o:p></o:p>

    a + b<o:p></o:p>

    Non exposition<o:p></o:p>

    c<o:p></o:p>

    d<o:p></o:p>

    c + d<o:p></o:p>

    Total <o:p></o:p>

    a + c<o:p></o:p>

    b + d<o:p></o:p>

    N<o:p></o:p>

    Le risque relatif = <o:p></o:p>

    Capture d’écran 2014-08-13 à 19.43.23

     

    <o:p> </o:p>

    Avantages <o:p></o:p>

    Inconvénients <o:p></o:p>

    Estimation directe du risque relatif<o:p></o:p>

    Meilleure adaptation<o:p></o:p>

    Contrôle de biais<o:p></o:p>

    Évaluation de l’influence facteur étudié<o:p></o:p>

    Étude longue et couteuse<o:p></o:p>

    Effectif important<o:p></o:p>

    Besoin d’une population stable<o:p></o:p>

    Incubation stable<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    III)      Enquête cas témoins<o:p></o:p>

    C’est une enquête rétrospective qui compare des sujets atteints d’une maladie à un sujet indemne par rapport à une exposition passé<o:p></o:p>

    Il n’y a pas de risque relatif mais des odds-ratio (si la maladie est rare)

    Capture d’écran 2014-08-13 à 19.45.04

     

     

    <o:p> </o:p>

    Avantages <o:p></o:p>

    Inconvénients <o:p></o:p>

    Enquête de courte durée<o:p></o:p>

    Cout modéré<o:p></o:p>

    Étude maladie rare et plusieurs facteurs<o:p></o:p>

    Peut être refaite plusieurs fois<o:p></o:p>

    Sélection délicate<o:p></o:p>

    Biais difficile à contrôler<o:p></o:p>

    Évaluation indirecte du risque relatif<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    IV)      Enquête transversale<o:p></o:p>

    On étudie l’existence de l’exposition et de la maladie<o:p></o:p>

    Elles sont mal adaptées aux études analytiques<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    V)         Puissance d’un test (1 – β = 80%)<o:p></o:p>

    C’est une probabilité qui détecte les différences qui existe entre deux groupes<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    VI)      Risque α = 5%<o:p></o:p>

    Rejeter H0 quand elle est vraie<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    VII)   Risque β = 20%<o:p></o:p>

    Rejeter H1 quand elle est vraie<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    VIII)Critique de jugement d’une relation de cause à effet<o:p></o:p>

    Elle évalue une séquence dans le temps : l’exposition précède la maladie.<o:p></o:p>

    - force d’association : précision avec laquelle une variable peut permettre de prédire l’autre<o:p></o:p>

    - spécificité cause effet : présence cause chez tous les malades<o:p></o:p>

    - relation type dose/effet : plus il y a exposition plus le risque augmente<o:p></o:p>

    - évaluation constante association et reproduction : différentes méthodes mènent à la même conclusion<o:p></o:p>

    - plausibilité biologique : cohérence des mécanismes actions / facteurs<o:p></o:p>


    votre commentaire

  • Les essais cliniques

    Par lafandemusic1994 le 13 Août 2014 à 19:43

     

    Les essais cliniques<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    I)            Définition, objectifs et enjeux<o:p></o:p>

    Évaluer par expérimentation une thérapeutique<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    II)         Impératifs d’un essai clinique<o:p></o:p>

    ·      Le tirage au sort<o:p></o:p>

    Affectation d’un participant au sein des groupes comparés contrôlée par tirage au sort<o:p></o:p>

    Il existe deux types d’essais : les essais parallèles (un groupe = un traitement) / les essais croisés (un groupe = un traitement / pause / deuxième traitement)<o:p></o:p>

    On effectue un TAS pour avoir la même probabilité d’être dans n’importe quel groupe.<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    ·      Le traitement en insu<o:p></o:p>

    La méthode à l’aveugle permet de prévenir des biais de jugement.<o:p></o:p>

    Double aveugle : patient, investigateur.<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    III)      Méthodologie d’un essaie clinique<o:p></o:p>

    ·      Objectif principal : question de recherche<o:p></o:p>

    On évoque dans la question :<o:p></o:p>

    - les traitements comparés<o:p></o:p>

    - la population étudié<o:p></o:p>

    - le critère de jugement principal<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    ·      Population de l’étude<o:p></o:p>

    On effectue des critères d’inclusion et de non inclusion qui permettent de refléter la population cible de façon positive<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    ·      Traitements comparés<o:p></o:p>

    Évaluation de la sécurité d’emploi<o:p></o:p>

    Préclinique<o:p></o:p>

    Expérimentation in vitro et sur l’animal<o:p></o:p>

    Précoce<o:p></o:p>

    Étude des conditions de tolérance chez l’homme (sain ou malade)<o:p></o:p>

    Évaluation de l’efficacité<o:p></o:p>

    Intermédiaire<o:p></o:p>

    Étude des conditions de l’efficacité et définition des modalités d’administration<o:p></o:p>

    Confirmatoire<o:p></o:p>

    Étude de l’efficacité et de la tolérance dans les indications invoquées<o:p></o:p>

    Tardive <o:p></o:p>

    Étude dans les conditions usuelles de prescription<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    ·      Critères de jugement<o:p></o:p>

    Formulation d’un critère de jugement  (définition / modalités / durée)<o:p></o:p>

    Propriétés d’un critère de jugement (pertinence et fiabilité)<o:p></o:p>

    Maitrise des biais d’information (calibration des investigateurs / mesure en double aveugles si possible)<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    ·      Taille de l’étude<o:p></o:p>

    À déterminer avant le début de l’inclusion dans l’étude<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    IV)      Analyse des résultats<o:p></o:p>

    ·      Caractéristiques des sujets éligibles<o:p></o:p>

    Résultats applicables à la population ciblée ?<o:p></o:p>

    Est-ce que les groupes ont bien été randomisés ?<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    ·      Perdus de vue<o:p></o:p>

    Abandon / absence de suivi è biais de sélection différentiel (sous ou surestimation)<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    ·      Déviation des sujets / protocole<o:p></o:p>

    Est-ce qu’il y a un bon suivi du traitement è est-ce que les résultats seront de qualités<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    ·      Analyse du critère de jugement<o:p></o:p>

    - Analyse en intention de traiter : vise à maintenir la comparabilité entre les deux groupes <o:p></o:p>

    Il n’y a pas d’exclusion du groupe / tous les sujets doivent être suivis jusqu’à la fin<o:p></o:p>

    - Analyse en « per protocol » : n’inclut que les patients qui ont suivi le traitement jusqu’à la fin<o:p></o:p>

    Explore l’efficacité théorique du traitement (biais d’attrition)<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    ·      Différence statistiquement significative et cliniquement pertinente<o:p></o:p>

    Variable qualitative dichotomique è différence cliniquement pertinente <o:p></o:p>

    Variable quantitative continue è différence non pertinente<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    V)         Aspects éthiques et réglementaires<o:p></o:p>

    ·      Conduite d’un essai<o:p></o:p>

    Repose sur la minutie<o:p></o:p>

    Acteurs de la recherche : promoteur / investigateurs / statisticien <o:p></o:p>

    Contrôle de qualité<o:p></o:p>

    Comité indépendant de la surveillance pour une impartialité des traitements<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    ·      Principes à respecter <o:p></o:p>

    Respect de la personne humaine<o:p></o:p>

    Ne pas nuire aux malades<o:p></o:p>

    Principe de justice<o:p></o:p>

    Principe du respect de la dignité de la science et de ses propres exigences méthodologiques<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    <o:p> </o:p>


    votre commentaire

  • Analyse de la survie

    Par lafandemusic1994 le 13 Août 2014 à 19:41

    Analyse de la survie<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    I)            Introduction<o:p></o:p>

    L’étude de survie est longitudinale, prospective, est fait l’observation de groupe de sujet.<o:p></o:p>

    C’est un centre d’intérêt<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    II)         Définition<o:p></o:p>

    Cohorte<o:p></o:p>

    Ensemble des sujets vivant un même événement au même moment<o:p></o:p>

    Cohorte incipiente<o:p></o:p>

    Cohorte incluant un sujet avec un début d’affection<o:p></o:p>

    Événement d’intérêt<o:p></o:p>

    Décès, survenue de la maladie, récurrence des symptômes<o:p></o:p>

    Durée de survie<o:p></o:p>

    Délai entre deux dates<o:p></o:p>

    Date d’origine<o:p></o:p>

    Point de départ de la surveillance<o:p></o:p>

    Date de point<o:p></o:p>

    Date de bilan, fin de la surveillance<o:p></o:p>

    Date des dernières nouvelles<o:p></o:p>

    Dernière date à laquelle on a recueilli des informations du patient<o:p></o:p>

    Perdu de vue<o:p></o:p>

    Patient pas suivi jusqu’à la date de point<o:p></o:p>

    Censure<o:p></o:p>

    Événement pas observé<o:p></o:p>

    Temps de recul<o:p></o:p>

    Délai entre la date d’origine et la date de point<o:p></o:p>

    Temps de participation<o:p></o:p>

    Durée de la surveillance utilisé dans l’estimation de survie<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    III)      Fonction de survie<o:p></o:p>

    Loi exponentielle<o:p></o:p>

    Durée de vie : S(t) = e-λt<o:p></o:p>

    Fonction de survie<o:p></o:p>

    Probabilité qu’un événement d’intérêt ne survienne pas avant t<o:p></o:p>

    Courbe de survie<o:p></o:p>

    Probabilité de survie après un délai t<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    IV)      Estimation de survie<o:p></o:p>

    Recueil des données<o:p></o:p>

    Date d’origine, de point, de dernières nouvelles, événement<o:p></o:p>

    Calcul des durées de survie<o:p></o:p>

    Date des dernières nouvelles – date d’origine<o:p></o:p>

    Calcul de la survie<o:p></o:p>

    Analyse actuarielle<o:p></o:p>

    Calculé sur des grands échantillons et sur des intervalles<o:p></o:p>

    V le nombre de vivant au début<o:p></o:p>

    D le nombre de décès<o:p></o:p>

    C le nombre de censure<o:p></o:p>

    Nombre de sujets exposés : N = V – (C/2)<o:p></o:p>

    Survie : (N – D) / N<o:p></o:p>

    Méthode de Kaplan Meier<o:p></o:p>

    Calculé sur des petits échantillons et sur des intervalles<o:p></o:p>

    V le nombre de vivant au début<o:p></o:p>

    D le nombre de décès<o:p></o:p>

    C le nombre de censure<o:p></o:p>

    Survie instantanée : (N – D) / N<o:p></o:p>

    Médiane de survie<o:p></o:p>

    Survie à 50%<o:p></o:p>

    Survie à date fixée<o:p></o:p>

    Survie à temps donnée<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    V)         Comparaison de deux fonctions de survie<o:p></o:p>

    C’est la comparaison du nombre observé et attendu d’événements<o:p></o:p>

    / !\ ne pas comparer par rapport au traitement<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    ·      Principe <o:p></o:p>

    Évalue un écrat entre le nombre observé et le nombre attendue d’événement sur les deux groupes est un chi2 à 1dll<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    ·      Estimation des décès<o:p></o:p>

    C’est la probabilité de décéder à ti sachant que l’on est vivant à ti – 1  <o:p></o:p>


    votre commentaire

  • Valeur informationnelle d?un signe

    Par lafandemusic1994 le 13 Août 2014 à 19:38

    Valeur informationnelle d’un signe<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    I)            Démarche diagnostic<o:p></o:p>

    Il existe 2 sources de diagnostic :  - Gold standard : test de référence (100% sûr) è pas toujours appliqué (examens pénibles, coût important, pas toujours disponible)<o:p></o:p>

                                                              - Le test :        Binaire : présence/absence<o:p></o:p>

                                                                                      Ordinal : échelle<o:p></o:p>

                                                                                      Quantitative : dosage / concentration<o:p></o:p>

    Les tests quantitatifs et ordinaux peut devenir binaux è positif / négatif<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    On fait un test diagnostic : imagerie, paraclinique, interrogatoire du patient, signes fonctionnels, physiques<o:p></o:p>

    Résultats :<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    <o:p> </o:p>

    Info sur la maladie<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    Malade<o:p></o:p>

    Non Malade<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    Résultat du test<o:p></o:p>

    Test positif<o:p></o:p>

    VP<o:p></o:p>

    FP<o:p></o:p>

    Totaux<o:p></o:p>

    è VPP<o:p></o:p>

    Test négatif<o:p></o:p>

    FN<o:p></o:p>

    VN<o:p></o:p>

    Totaux<o:p></o:p>

    è VPN<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    Totaux<o:p></o:p>

    Totaux<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    è sensibilité<o:p></o:p>

    è spécificité<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    Sensibilité (Se) è VP / totaux<o:p></o:p>

    Spécificité (Sp) è VN / totaux<o:p></o:p>

    La Se et la Sp sont comprise entre 0 et 1, exprimée en %, indépendantes de la prévalence, dépendent du seuil è valeurs intrinsèque au test<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    <o:p> </o:p>

    Cas représentatif de la population<o:p></o:p>

    Cas non représentatif de la population è théorème de Bayes<o:p></o:p>

    VPP<o:p></o:p>

    VP / totaux<o:p></o:p>

    		 Capture d’écran 2014-08-13 à 19.35.49

    VPN<o:p></o:p>

    VN / totaux<o:p></o:p>

    		 Capture d’écran 2014-08-13 à 19.35.55

    è Ce sont des valeurs extrinsèques au test <o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    Le seuil permet d’évaluer la valeur diagnostic d’un test, il est défini par le gold standard, ne dépend pas de la population<o:p></o:p>

    La prévalence dépend de la population<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    II)         Courbe ROC<o:p></o:p>

    Permet de choisir la meilleure sensibilité et la meilleure spécificité<o:p></o:p>

    Le seuil optimum est le couple (Se ; 1-Sp) le plus près du coin supérieur gauche<o:p></o:p>

    <o:p> </o:p>

    <o:p> </o:p>

    III)      Dépistage<o:p></o:p>

    C’est une prévention secondaire sur une population à risque avec un test fiable et/ou un traitement qui réduit la mortalité<o:p></o:p>


    votre commentaire


    Suivre le flux RSS des articles de cette rubrique
    Suivre le flux RSS des commentaires de cette rubrique