-
Indicateur en épidémiologie<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
I) Rappel<o:p></o:p>
Il y a deux types de statistiques : les diagnostiques et les thérapeutiques.<o:p></o:p>
Les données sont les résultats de l’observation.<o:p></o:p>
Si on peut la mesurer, la variable peut être :<o:p></o:p>
- qualitative : 1 modalité (binaire ou nominale) ou 2 modalités (en tableau)<o:p></o:p>
- quantitative : associée à un nombre<o:p></o:p>
- ordinale : peuvent être ordonnées<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
Les données qualitatives peuvent être sous forme de tableau, camembert, diagramme en bâtons. Quand il y a beaucoup de réponses qualitatives, on calcule la fréquence à une réponse.<o:p></o:p>
Les données quantitatives sont calculés sous forme d’effectifs cumulés croissants
On peut aussi avoir un histogramme par intervalle [a ; b], p = h(b – a)<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
II) Paramètres statistiques<o:p></o:p>
III) Applications <o:p></o:p>
Épidémiologie descriptive : fréquence et répartition des problèmes de santé<o:p></o:p>
Épidémiologie analytique (hypothèse) : cause<o:p></o:p>
Épidémiologie évaluative (validation hypothèse) : apprécie les résultats/actions<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
· Indicateur en épidémiologie<o:p></o:p>
Permet de mesurer l’état de santé :<o:p></o:p>
- sociodémographique<o:p></o:p>
- sanitaire<o:p></o:p>
- utilisation des services de santé<o:p></o:p>
- mesure activité et évalue<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
· Mesure épidémiologique<o:p></o:p>
- proportion : en pourcentage<o:p></o:p>
- ratio : rapport entre deux classes<o:p></o:p>
- cote : rapport de probabilité survenue et non survenue<o:p></o:p>
- indice : rapport de deux effectifs de nature différentes<o:p></o:p>
- taux : rapport prenant en compte la notion de temps<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
votre commentaire -
Statistiques interférentielles en épidémiologie<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
<o:p> </o:p>
<o:p></o:p>Une hypothèse est une relation entre deux variables, une problématique de recherche.<o:p></o:p>
Une inférence permet une généralisation à partir d’un échantillon, d’une population source jusqu’à une population cible.<o:p></o:p>
Le risque est une probabilité d’être atteint d’une maladie.<o:p></o:p>
Le risque relatif est le risque d’être exposé sur le risque d’être non exposé.<o:p></o:p>
Le facteur de risque est un facteur influençant la survenue d’un problème de santé.<o:p></o:p>
L’intervalle de confiance du risque relatif = 95%<o:p></o:p>
Si l’intervalle contient 1 alors l’association est dite non significative et p ≥ 5%<o:p></o:p>
Si l’intervalle ne contient pas 1 alors l’association est dite significative et p < 0,05<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
I) Problème des enquêtes d’observation<o:p></o:p>
Biais de sélection<o:p></o:p>
Constitution des groupes, non représentatif<o:p></o:p>
Réglé par un TAS<o:p></o:p>
Biais de mesure<o:p></o:p>
Mesure de l’exposition à la maladie en sous/surestimation<o:p></o:p>
On doit bien faire la distinction entre malades et non malades<o:p></o:p>
Problème de comparabilité des groupes<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
<o:p> </o:p>
Biais de confusion<o:p></o:p>
Concerne la non comparabilité des groupes pour différents facteurs autre que la facteur étudié<o:p></o:p>
Il faut bien appareiller et ajuster les groupes<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
II) Enquête de cohorte<o:p></o:p>
C’est une enquête prospective sur l’exposition au facteur de risque chez un individu sain<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
Malade<o:p></o:p>
Non malade<o:p></o:p>
Total <o:p></o:p>
Exposition<o:p></o:p>
a<o:p></o:p>
b<o:p></o:p>
a + b<o:p></o:p>
Non exposition<o:p></o:p>
c<o:p></o:p>
d<o:p></o:p>
c + d<o:p></o:p>
Total <o:p></o:p>
a + c<o:p></o:p>
b + d<o:p></o:p>
N<o:p></o:p>
Le risque relatif = <o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
Avantages <o:p></o:p>
Inconvénients <o:p></o:p>
Estimation directe du risque relatif<o:p></o:p>
Meilleure adaptation<o:p></o:p>
Contrôle de biais<o:p></o:p>
Évaluation de l’influence facteur étudié<o:p></o:p>
Étude longue et couteuse<o:p></o:p>
Effectif important<o:p></o:p>
Besoin d’une population stable<o:p></o:p>
Incubation stable<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
III) Enquête cas témoins<o:p></o:p>
C’est une enquête rétrospective qui compare des sujets atteints d’une maladie à un sujet indemne par rapport à une exposition passé<o:p></o:p>
Il n’y a pas de risque relatif mais des odds-ratio (si la maladie est rare)
<o:p> </o:p>
Avantages <o:p></o:p>
Inconvénients <o:p></o:p>
Enquête de courte durée<o:p></o:p>
Cout modéré<o:p></o:p>
Étude maladie rare et plusieurs facteurs<o:p></o:p>
Peut être refaite plusieurs fois<o:p></o:p>
Sélection délicate<o:p></o:p>
Biais difficile à contrôler<o:p></o:p>
Évaluation indirecte du risque relatif<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
IV) Enquête transversale<o:p></o:p>
On étudie l’existence de l’exposition et de la maladie<o:p></o:p>
Elles sont mal adaptées aux études analytiques<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
V) Puissance d’un test (1 – β = 80%)<o:p></o:p>
C’est une probabilité qui détecte les différences qui existe entre deux groupes<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
VI) Risque α = 5%<o:p></o:p>
Rejeter H0 quand elle est vraie<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
VII) Risque β = 20%<o:p></o:p>
Rejeter H1 quand elle est vraie<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
VIII)Critique de jugement d’une relation de cause à effet<o:p></o:p>
Elle évalue une séquence dans le temps : l’exposition précède la maladie.<o:p></o:p>
- force d’association : précision avec laquelle une variable peut permettre de prédire l’autre<o:p></o:p>
- spécificité cause effet : présence cause chez tous les malades<o:p></o:p>
- relation type dose/effet : plus il y a exposition plus le risque augmente<o:p></o:p>
- évaluation constante association et reproduction : différentes méthodes mènent à la même conclusion<o:p></o:p>
- plausibilité biologique : cohérence des mécanismes actions / facteurs<o:p></o:p>
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Les essais cliniques<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
I) Définition, objectifs et enjeux<o:p></o:p>
Évaluer par expérimentation une thérapeutique<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
II) Impératifs d’un essai clinique<o:p></o:p>
· Le tirage au sort<o:p></o:p>
Affectation d’un participant au sein des groupes comparés contrôlée par tirage au sort<o:p></o:p>
Il existe deux types d’essais : les essais parallèles (un groupe = un traitement) / les essais croisés (un groupe = un traitement / pause / deuxième traitement)<o:p></o:p>
On effectue un TAS pour avoir la même probabilité d’être dans n’importe quel groupe.<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
· Le traitement en insu<o:p></o:p>
La méthode à l’aveugle permet de prévenir des biais de jugement.<o:p></o:p>
Double aveugle : patient, investigateur.<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
III) Méthodologie d’un essaie clinique<o:p></o:p>
· Objectif principal : question de recherche<o:p></o:p>
On évoque dans la question :<o:p></o:p>
- les traitements comparés<o:p></o:p>
- la population étudié<o:p></o:p>
- le critère de jugement principal<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
· Population de l’étude<o:p></o:p>
On effectue des critères d’inclusion et de non inclusion qui permettent de refléter la population cible de façon positive<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
· Traitements comparés<o:p></o:p>
Évaluation de la sécurité d’emploi<o:p></o:p>
Préclinique<o:p></o:p>
Expérimentation in vitro et sur l’animal<o:p></o:p>
Précoce<o:p></o:p>
Étude des conditions de tolérance chez l’homme (sain ou malade)<o:p></o:p>
Évaluation de l’efficacité<o:p></o:p>
Intermédiaire<o:p></o:p>
Étude des conditions de l’efficacité et définition des modalités d’administration<o:p></o:p>
Confirmatoire<o:p></o:p>
Étude de l’efficacité et de la tolérance dans les indications invoquées<o:p></o:p>
Tardive <o:p></o:p>
Étude dans les conditions usuelles de prescription<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
· Critères de jugement<o:p></o:p>
Formulation d’un critère de jugement (définition / modalités / durée)<o:p></o:p>
Propriétés d’un critère de jugement (pertinence et fiabilité)<o:p></o:p>
Maitrise des biais d’information (calibration des investigateurs / mesure en double aveugles si possible)<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
· Taille de l’étude<o:p></o:p>
À déterminer avant le début de l’inclusion dans l’étude<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
IV) Analyse des résultats<o:p></o:p>
· Caractéristiques des sujets éligibles<o:p></o:p>
Résultats applicables à la population ciblée ?<o:p></o:p>
Est-ce que les groupes ont bien été randomisés ?<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
· Perdus de vue<o:p></o:p>
Abandon / absence de suivi è biais de sélection différentiel (sous ou surestimation)<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
· Déviation des sujets / protocole<o:p></o:p>
Est-ce qu’il y a un bon suivi du traitement è est-ce que les résultats seront de qualités<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
· Analyse du critère de jugement<o:p></o:p>
- Analyse en intention de traiter : vise à maintenir la comparabilité entre les deux groupes <o:p></o:p>
Il n’y a pas d’exclusion du groupe / tous les sujets doivent être suivis jusqu’à la fin<o:p></o:p>
- Analyse en « per protocol » : n’inclut que les patients qui ont suivi le traitement jusqu’à la fin<o:p></o:p>
Explore l’efficacité théorique du traitement (biais d’attrition)<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
· Différence statistiquement significative et cliniquement pertinente<o:p></o:p>
Variable qualitative dichotomique è différence cliniquement pertinente <o:p></o:p>
Variable quantitative continue è différence non pertinente<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
V) Aspects éthiques et réglementaires<o:p></o:p>
· Conduite d’un essai<o:p></o:p>
Repose sur la minutie<o:p></o:p>
Acteurs de la recherche : promoteur / investigateurs / statisticien <o:p></o:p>
Contrôle de qualité<o:p></o:p>
Comité indépendant de la surveillance pour une impartialité des traitements<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
· Principes à respecter <o:p></o:p>
Respect de la personne humaine<o:p></o:p>
Ne pas nuire aux malades<o:p></o:p>
Principe de justice<o:p></o:p>
Principe du respect de la dignité de la science et de ses propres exigences méthodologiques<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
<o:p> </o:p>
votre commentaire -
Analyse de la survie<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
I) Introduction<o:p></o:p>
L’étude de survie est longitudinale, prospective, est fait l’observation de groupe de sujet.<o:p></o:p>
C’est un centre d’intérêt<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
II) Définition<o:p></o:p>
Cohorte<o:p></o:p>
Ensemble des sujets vivant un même événement au même moment<o:p></o:p>
Cohorte incipiente<o:p></o:p>
Cohorte incluant un sujet avec un début d’affection<o:p></o:p>
Événement d’intérêt<o:p></o:p>
Décès, survenue de la maladie, récurrence des symptômes<o:p></o:p>
Durée de survie<o:p></o:p>
Délai entre deux dates<o:p></o:p>
Date d’origine<o:p></o:p>
Point de départ de la surveillance<o:p></o:p>
Date de point<o:p></o:p>
Date de bilan, fin de la surveillance<o:p></o:p>
Date des dernières nouvelles<o:p></o:p>
Dernière date à laquelle on a recueilli des informations du patient<o:p></o:p>
Perdu de vue<o:p></o:p>
Patient pas suivi jusqu’à la date de point<o:p></o:p>
Censure<o:p></o:p>
Événement pas observé<o:p></o:p>
Temps de recul<o:p></o:p>
Délai entre la date d’origine et la date de point<o:p></o:p>
Temps de participation<o:p></o:p>
Durée de la surveillance utilisé dans l’estimation de survie<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
III) Fonction de survie<o:p></o:p>
Loi exponentielle<o:p></o:p>
Durée de vie : S(t) = e-λt<o:p></o:p>
Fonction de survie<o:p></o:p>
Probabilité qu’un événement d’intérêt ne survienne pas avant t<o:p></o:p>
Courbe de survie<o:p></o:p>
Probabilité de survie après un délai t<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
IV) Estimation de survie<o:p></o:p>
Recueil des données<o:p></o:p>
Date d’origine, de point, de dernières nouvelles, événement<o:p></o:p>
Calcul des durées de survie<o:p></o:p>
Date des dernières nouvelles – date d’origine<o:p></o:p>
Calcul de la survie<o:p></o:p>
Analyse actuarielle<o:p></o:p>
Calculé sur des grands échantillons et sur des intervalles<o:p></o:p>
V le nombre de vivant au début<o:p></o:p>
D le nombre de décès<o:p></o:p>
C le nombre de censure<o:p></o:p>
Nombre de sujets exposés : N = V – (C/2)<o:p></o:p>
Survie : (N – D) / N<o:p></o:p>
Méthode de Kaplan Meier<o:p></o:p>
Calculé sur des petits échantillons et sur des intervalles<o:p></o:p>
V le nombre de vivant au début<o:p></o:p>
D le nombre de décès<o:p></o:p>
C le nombre de censure<o:p></o:p>
Survie instantanée : (N – D) / N<o:p></o:p>
Médiane de survie<o:p></o:p>
Survie à 50%<o:p></o:p>
Survie à date fixée<o:p></o:p>
Survie à temps donnée<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
V) Comparaison de deux fonctions de survie<o:p></o:p>
C’est la comparaison du nombre observé et attendu d’événements<o:p></o:p>
/ !\ ne pas comparer par rapport au traitement<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
· Principe <o:p></o:p>
Évalue un écrat entre le nombre observé et le nombre attendue d’événement sur les deux groupes est un chi2 à 1dll<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
· Estimation des décès<o:p></o:p>
C’est la probabilité de décéder à ti sachant que l’on est vivant à ti – 1 <o:p></o:p>
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Valeur informationnelle d’un signe<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
I) Démarche diagnostic<o:p></o:p>
Il existe 2 sources de diagnostic : - Gold standard : test de référence (100% sûr) è pas toujours appliqué (examens pénibles, coût important, pas toujours disponible)<o:p></o:p>
- Le test : Binaire : présence/absence<o:p></o:p>
Ordinal : échelle<o:p></o:p>
Quantitative : dosage / concentration<o:p></o:p>
Les tests quantitatifs et ordinaux peut devenir binaux è positif / négatif<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
On fait un test diagnostic : imagerie, paraclinique, interrogatoire du patient, signes fonctionnels, physiques<o:p></o:p>
Résultats :<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
<o:p> </o:p>
Info sur la maladie<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
Malade<o:p></o:p>
Non Malade<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
Résultat du test<o:p></o:p>
Test positif<o:p></o:p>
VP<o:p></o:p>
FP<o:p></o:p>
Totaux<o:p></o:p>
è VPP<o:p></o:p>
Test négatif<o:p></o:p>
FN<o:p></o:p>
VN<o:p></o:p>
Totaux<o:p></o:p>
è VPN<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
Totaux<o:p></o:p>
Totaux<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
è sensibilité<o:p></o:p>
è spécificité<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
Sensibilité (Se) è VP / totaux<o:p></o:p>
Spécificité (Sp) è VN / totaux<o:p></o:p>
La Se et la Sp sont comprise entre 0 et 1, exprimée en %, indépendantes de la prévalence, dépendent du seuil è valeurs intrinsèque au test<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
è Ce sont des valeurs extrinsèques au test <o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
Le seuil permet d’évaluer la valeur diagnostic d’un test, il est défini par le gold standard, ne dépend pas de la population<o:p></o:p>
La prévalence dépend de la population<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
II) Courbe ROC<o:p></o:p>
Permet de choisir la meilleure sensibilité et la meilleure spécificité<o:p></o:p>
Le seuil optimum est le couple (Se ; 1-Sp) le plus près du coin supérieur gauche<o:p></o:p>
<o:p> </o:p>
<o:p> </o:p>
III) Dépistage<o:p></o:p>
C’est une prévention secondaire sur une population à risque avec un test fiable et/ou un traitement qui réduit la mortalité<o:p></o:p>
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